动画剧情舞台为2047年,与人类之敌「D2」对抗而荒废的美国。指挥家「朝雏タクト」与「Musicart」的少女「命运」,在失去音乐的世界中各自为了自身的渴望,共同出发前往纽约。
作为实现愿望的代价,在无人知晓的情况下不断战斗的魔法少女们。然而,环伊吕波,却忘记了自己的愿望。“成为魔法少女的时候,我是许了什么愿望来着?”日常当中突然出现的空洞。失去了的某件重要之物。连理由都不知
最强魔术士,再临。「想要与我做个了断的话,就来基姆拉克吧」在义姐·阿莎莉留下的话语引导下,欧菲等人前往与魔术士极度对立的基姆拉克。他们突然听到了悲鸣而赶往现场,在累累尸山中遭遇了与敌人果敢战斗的女剑士